Діагностичні набори «Біокор Текнолоджі» дають змогу виявляти новий варіант коронавірусу «Омікрон» без його детальної диференціації

За допомогою компьютерного моделювання фахівці ТОВ “Біокор Текнолоджі” оцінили можливість своїх діагностичних наборів «Biocore® SARS-CoV-2» виявляти новий варіант корона вірусу B.1.1.529 (Omicron).

Діагностичні набори для виявлення «Biocore® SARS-CoV-2» виробництва ТОВ «Біокор Текнолоджі ЛТД» мають багатоцільовий дизайн (ORF1ab, N – гени). Для визначення потенційного впливу відомих мутацій виробник постійно проводить оцінювання своєї продукції за допомогою комп’ютерного моделювання (in silico assessment). Порівняльний аналіз зон ампліфікації, що використовуються у наборах виробництва компанії, показав відсутність варіацій між нуклеотидними послідовностями референтного (Wuhan-Hu-1) і мутантного (B.1.1.529 Omicron) штамів SARS-CoV-2. Таким чином, набір діагностичний «Biocore® SARS-CoV-2» для виявлення РНК коронавірусу SARS-CoV-2 методом ЗТ-ПЛР у реальному часі дає змогу визначати варіант B.1.1.529 (Omicron) без його детальної диференціації.

Нагадаємо, 26 листопада 2021 р. ВООЗ за рекомендацією Технічної консультативної групи з еволюції вірусу SARS-CoV-2 (ТКГЕВ) оголосила варіант B.1.1.529 таким, що викликає занепокоєння, і надала йому найменування «Омікрон». Рішення було прийнято на основі представлених ТКГЕВ фактичних даних про те, що варіант «Омікрон» має кілька нових мутацій, які можуть вплинути на його властивості, зокрема на його здатність до поширення або тяжкість захворювання, що викликається ним. Також дані мутації можуть суттєво вплинути на діагностичні характеристики діагностикумів, що використовуються для визначення SARS-CoV-2.

Варіант SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) належить до лінії поколінь B.1.1 і характеризується 30 амінокислотними замінами, трьома невеликими делеціями та однією невеликою інсерцією в спайковому (S) білку порівняно з оригінальним вірусом (Wuhan-Hu-1): A67V, Δ69-70, T95I, G142D, Δ143-145, Δ211, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F. Він також несе ряд амінокислотних замін і делецій в інших елементах геному: ORF1ab (K38R, V1069I, Δ1265, L1266I, A1892T, T492I, P132H, Δ105-107, A189V, P323L, I42V); поверхневий білок (T9I); мембранний білок (D3G, Q19E, A63T); нуклеокапсидний білок (P13L, Δ31-33, R203K, G204R).

• Департамент молекулярної та клітинної біології (ТОВ АЛТ Україна) – +380 (44) 492-72-70
• Відділ молекулярной біології та генетики (ТОВ ХІМЛАБОРРЕАКТИВ) – +380 (44) 494 42 42
• Відділ продажів (ТОВ МЕДЛАБГАРАНТ-ІФ) – +380 (50) 645-66-58